Originaire de Suisse où il naît en 1960, Stephan Eicher pratique la musique dès sa plus tendre enfance grâce à son père, violoniste de jazz à ses heures perdues. Après des études dans un internat et de multiples petits boulots, il se découvre une vocation pour la chanson.
En 1980, il décide de monter son propre groupe, Grauzone, où il joue du synthétiseur et de la guitare. Leur premier album Eisbär connaît un immense succès mais le jeune chanteur préfère alors prendre ses distances. Il quitte le monde de la musique pendant près d’un an avant de rencontrer le groupe Liliput, avec lequel il part en tournée en France et en Allemagne. De festivals en festivals, Stephan Eicher réussit à se faire remarquer et à attirer l’attention du public grâce à des chansons comme Two People in a Room en 1986 ou encore Combien de temps en 1988. Ses succès lui permettent même d’accéder à la prestigieuse scène de l’Olympia à Paris.
Sa carrière connaît son apogée au cours des années 90 grâce à son album Engelberg, qui devient un immense succès en France et en Suisse. Toujours à la recherche de nouveaux challenges, il passe facilement de l’électro au rock et surprend même le public avec son album 1000 vies, où il dévoile son talent pour la musique symphonique. Si le public est légèrement déconcerté par ce nouveau style, il le retrouve dès 1999 avec son album Louanges et au travers de ses multiples collaborations avec des artistes comme Patricia Kaas et Johnny Hallyday.
En 2019, il revient sur le devant de la scène avec l'album Homeless Songs. En 2022, il publie son nouvel EP Autour de ton cou, issu de son album Ode.
Côté vie privée, il a deux fils; Carlo, né en 1984 à Zurich, et Raphaël, né à Paris en 2000.